臺北市文山區志清國民小學組織架構圖  下設教務處、學生事務處、總務處、輔導室、人事室、會計室、幼兒園，共計3處、3室、1幼兒園。

● 校長室 : 綜理全校校務。 

● 教務處 : 辦理教師專業成長、學校課程發展、教師教學及職務編配、閱讀推廣入學及轉學、行政電子化、資訊融入教學、學生課後照顧、補救教學及其有關業務。

● 學務處: 辦理環境教育、學生輔導與管教、學生獎懲、校園遊戲安全、友善校園(含人權、品德、法治、中輟與春暉教育)、生活教育、衛生保健、健康促進、學童午餐、各項學生體育項目推動、學生校內外活動及其有關業務。

● 總務處 : 辦理校舍營繕工程、校舍及財產管理、環境綠美化、公文及檔案管理、各項物品   採購、校園門禁管理、出納保管登記事項及其有關業務。

● 輔導室 : 辦理負責學生個案諮商與輔導、親職教育、生命教育、特殊教育、家庭暴力防治及性別平等教育、社福及心理衛生資源整 合及其有關業務。

● 會計室 : 辦理歲計、會計業務。

● 人事室: 辦理人事管理業務 。

● 幼兒園：負責幼兒園課程計畫、教師教學及職務、補助款申請、幼兒保育及其有關事項。